「讓個案得到專業且有品質的醫療服務」及
「讓治療師得到適當的待遇」是星星碼頭治療所的兩大使命。
「全人」、「全程」的長期治療模式，讓治療師能夠安心地陪伴孩子長大。治療師除了能夠在早療領域協助特殊孩子，步入學齡、國高中生的青少年亦需要治療師的專業協助。家長也能在星星碼頭心理師的支持下，獲得同理與支持，星星碼頭不僅關心孩子，更關心圍繞著孩子的每一個重要他人。
星星碼頭治療師們不需要倉促地讓孩子畢業，而是可以安穩地陪伴孩子走過人生每一個重要階段。
「讓治療師得到適當的待遇」亦是星星碼頭的重要理念。有鑑於現況下治療師專業與其受薪落差之情形，我們認為：「專業、用心的職能治療師/心理師值得更友善、合理的對待。」治療所致力於提供完善的訓練、防疫措施及福利制度，支持治療師發展專長，且讓治療師能夠安心發揮所長。
同理、支持、感受、愛
同理：理解並欣賞特殊兒的直率、熱情、獨特，給予專業的評估與協助。
支持：成為家長與孩子最堅強的後盾，治療團隊之間彼此信任、互助合作。
感受：感受孩子與家長的苦惱、掙扎、憤怒、淚水，一同準備、練習、歡欣、成長。
愛：用真誠的「愛」塑造孩子和家長停泊的休憩所，在獲得滿滿能量後，
能夠懷抱堅定期待、踏出勇敢的步伐前進。
星星碼頭陪孩子一同準備好，長大。
